木薯渣發酵后一般用于養豬養羊等。發酵后木薯渣會產生大量活菌。木薯渣中的蛋白質氨基酸等營養物質被發酵分解能夠大大提高飼料的吸收率，并形成促長因子，另外發酵的飼料里面含有大量益生菌，動物吃后對腸道細菌的清理有很好的作用，能夠保健腸道的健康。

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木薯渣中的主要成分是淀粉和纖維素，還含有少量的蛋白質，大部分的養殖戶把木薯渣和精飼料混合后喂雞、鴨、鵝、豬、牛等動物從而節約成本。木薯渣處理的好，不僅可以節約成本，還可以使木薯渣里的營養物質得到充分的吸收利用，動物愛吃，不影響生長。但是木薯渣處理不好的話，就會得不償失，不僅浪費，而且還容易使動物食物中毒，生病造成損失。木薯渣存放的時間短，一般一兩天內就會變質發霉，要想長期儲存到達好的效果，要用養殖菌種發酵來喂。

養殖菌種發酵木薯渣操作技術

發酵方法（純木薯渣發酵喂豬）：取菌碼特養殖菌種發酵液1公斤與10公斤以上玉米面（麥粉，薯干粉，木薯粉，高粱粉也可以，數量可越多越好），攪拌均勻，用來拌和200公斤的木薯渣，食鹽1.5公斤，含水量調控在50%（采用有益微生物對于水分含量要求的標準是：水分可以過多，不可以過少。現在的標準是：手抓一把飼料，輕輕一握，即有少量水滴出，或手指間有水印出即可，這就是最好的含水量，這個含水量一般是50～70%。所有采用有益微生物飼料的含水量都要遵循這個規則，因為有益微生物在處理飼料時需要豐富的水分才能發揮效力），然后裝入池或缸內壓實或者袋子內，用塑料薄膜蓋好缸口，上面再加一層紡織袋保護塑料薄膜，用繩子扎緊，一般需要發酵3～7天，有甜酒醇香氣味，即可用來喂豬。木薯渣發酵飼料上的配比可自由調配。如（木薯渣60%其他40%、、木薯渣80%麥麩玉米粉20%、等）

菌碼特養殖菌種發酵木薯渣喂牛羊的好處

1、發酵時間短，并可以長期保存；
2、營養提高和釋放：本技術能夠快速降解其粗纖維，提高營養和消化吸收率，其效率是一般發酵和煮熟的三倍以上，可以大幅度提高木薯渣在飼養中的使用量，最大限度地達到降低飼料成本的目的。

3、大幅度降低飼料成本。卻能達到很好的生長速度。

4、發酵后適口性較好，動物喜歡吃。

5、大大降解了抗營養因子，提高抗病力發酵后能顯著增加其消化吸收率和降解抗營養因子，并含大量有益因子提高了抗病性能。
6、節省了飼料成本，提高經濟效益發酵以后可以代替很大一部分飼料，把飼料成本節省了，并且豬少得病，出欄提前，總之經濟效益提高了。

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發酵好的木薯渣密封好，能夠儲存一年不變質（一般建議在一個月內使用完最好），保存的過程中一定要嚴格的密封，不然就會引起酒度升高、酸度增加，對動物飼喂酒度過高的發酵木薯渣就有可能引起酒醉，木薯渣在酸度過高的情況下，動物就會不喜歡吃（但可以用1～3%小蘇打粉即純堿來中和）。長期飼喂發酵后的粗飼料，動物吃后，明顯提高抗病力和消化吸收率。